全馆以木质教育为主题，曲面墙玻璃外观，不仅为金门首创，更将林务所发展方向，由传统保林、育林，推展至更贴近生活的木育感官新境界。馆内分为三个区域，分别为传统聚落区、树木故事屋及积木游艺区。其中传统聚落区有两组大型积木古厝，是金门首创传统闽南式的一落二榉头古厝之模型，每一块大积木需要大人及小孩同心协力共同组装，组建积木的过程中，不仅可以认识金门在地传统古厝的基本结构及名称，也能增进参与学童思考讨论及互相分工合作的观念。 树木故事屋，蒐集有关木育、生态相关的童书及工具书，以沐浴在森林中享受阅读的设计理念，另一旁之小树洞则创造舒适、静谧的秘密基地，就像是在倾听大自然森林的秘密。 积木游艺区则是一个多功能的开放空间，独创的曲面投影幕、组合桌椅柜及超过五十组以上木制游具，采开放性玩法，激发参与孩童的想像力、创造力和解决问题的能力；木材温润的触感，让民众在体验中接触木育，认识木育。